Główną bohaterką jest 36-letnia Keiko, która mimo swojego wieku nadal pracuje dorywczo w sklepie, w którym zazwyczaj pracują tylko studenci. Pomimo ogólnie przyjętych reguł społecznych, dziewczyna nie dąży do kariery ani nie chce założyć rodziny.
Już jako mała dziewczynka miała problem z dopasowaniem się do społeczeństwa oraz z przejawianiem emocji. Praca w konbini, gdzie rzadzą ścisle określone zasady i przewidywalność zdarzeń, zapewniają Keiko komfort i bezpieczeństwo.
„Dziewczyna z konbini” to książka o inności, którą nie zawsze można zaszufladkować.